第16期:多模态磁共振数据分析手把手基础班
2021.03.23-2021.03.28(周二 ~周日)
主办单位:杭州脑海科技有限公司
协办单位:杭州师范大学心理科学研究院
1. 特色如下
1)课程时间充足,在杭州为期6天的系统培训(03月23日-03月28日)
2) 通过合理的课程设计,为学员后续多模态数据分析打下坚实基础,内容涵盖:
A. 功能:任务态MRI数据分析
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任务态数据预处理
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任务态block及event-related数据分析原理及操作
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经典任务态实验范式应用与数据分析
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心理生理交互作用(PPI)理论与实操
B. 功能:静息态MRI数据分析
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格兰杰因果分析(GCA)原理及操作
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独立成分分析(ICA)
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局部指标计算(如:ALFF、fALFF、PerAF、ReHo等)
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FCD、FCS、Functional connectivity等指标计算
C. 结构:基于体素的形态学分析
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基于体素的形态学分析:原理及应用
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横向数据以及纵向数据的形态学分析方法(CAT12)
D. 结构:弥散张量成像(DTI)
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FA、MD、AD、RD指标计算
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TBSS原理及分析实操
3)基础课程设置合理扎实,内容包含:
A. 磁共振实验设计及数据采集注意事项
B.MRI数据分析指标在文章中的应用及常见问题
C. 基于坐标的Meta分析(ALE)
D. 统计分析(1):T检验、单因素ANOVA以及双因素的ANOVA分析
E. 统计分析(2):多重比较校正原理及操作(FWE、FDR、GRF、AlphaSim以及TFCE等)
F. 多模态数据分析结果呈现(图以及表的制作)
2. 课程说明
根据大家的反馈与要求,我们再次更新了课程体系,希望尽可能让学员在6天内可以掌握更多的内容。近年来随着技术的不断发展,脑科学引起越来越多研究者的兴趣。目前磁共振已逐渐被广泛应用于神经、精神、消化、认知等医学和心理学领域,用于探索大脑发育、老化、情绪加工、运动障碍及记忆巩固等机制。掌握磁共振数据处理技术变得越来越重要。
本次课程内容相对基础,几乎涵盖了所有适合初学者掌握的技术,课程内容覆盖多模态技术,包括:任务态、静息态、结构像(形态学分析及DTI)。对于已有数据的学员可以快速上手多模态数据分析,对于没有数据的学员也可以尝试Meta分析。
本课程为期6天,课程设计环环相扣,为确保大家在6天内可以充分的掌握内容,我们承诺:
每期都会根据学员人数安排充足的助教,保证手把手指导分析数据(注:脑海科技
团队一共拥有10余人的助教)。确保急需掌握数据分析的临床医生以及科研工作者在6天快速掌握需要的数据分析技术。希望我们的培训班可以最大程度的满足零基础学员的快速掌握数据分析重要原理及相应技术的需求。
注:请提前一天到会场2021年03月22日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。
3. 课程安排
3月23日 |
第
1
天 |
张韬 |
上午 |
基础概念及数据预处理 |
功能磁共振基础概念介绍 |
功能磁共振数据整理以及常见问题 |
静息态数据预处理介绍 |
任务态数据预处理与静息态的区别 |
下午 |
静息态数据分析指标入门 |
数据分析预处理原理解读以及注意事项 |
ALFF、fALFF、PerAF算法介绍及操作 |
ReHo算法介绍及操作 |
晚上 |
CAT12:基于体素的形态学分析(VBM) |
基于体素的形态学分析:原理及应用 |
横向数据以及纵向数据的形态学分析方法 |
CAT12软件的应用介绍以及形态学指标的计算 |
基于体素的形态学分析的统计方法介绍与实操 |
3月24日 |
第2天 |
贾熙泽 |
上午 |
任务态数据分析入门 |
多模态数据分析课程体系介绍 |
任务态数据分析入门及基本原理 |
张韬 |
任务态数据分析基本操作 |
黄国峰 |
下午 |
DTI基础及入门分析 |
Linux基础操作入门 |
张韬 |
DTI基础原理 |
DTI数据分析操作基本流程及FSL初步使用 |
FA、MD、AD、RD指标计算 |
张韬 |
晚上 |
DTI数据分析进阶 |
TBSS数据分析原理介绍 |
TBSS数据分析步骤解读及实操 |
DTI数据分析结果呈现 |
DTI数据分析结果的统计分析 |
3月25日 |
第3天 |
王春杰 |
上午 |
任务态:经典实验范式解析 |
任务态实验设计解析及注意事项 |
经典任务态实验范式介绍 |
经典任务态实验范式数据分析实操 |
王春杰 |
下午 |
任务态:PPI分析 |
心理生理交互作用(PPI)基础理论:多元回归分析交互作用简介及应用举例 |
PPI原理简介及应用举例 |
PPI上机操作(实验设计、VOI定义、模型构建、统计分析、结果呈现等) |
张韬 |
晚上 |
独立成分分析(ICA) |
独立成分分析原理 |
ICA成分数选择及成分挑选 |
使用GIFT实操分析ICA |
3月26日 |
第4天 |
张韬 |
上午 |
T检验及多重比较校正 |
单样本T检验 |
双样本T检验 |
配对样本T检验 |
多重比较校正介绍 |
FDR、FWE原理及实操 |
GRF、AlphaSim原理及实操 |
TFCE原理及实操 |
张韬 |
下午 |
方差分析 |
单因素方差分析(多组) |
单因素方差分析(重复测量) |
2*2设计的方差分析 |
双因素方差分析 |
多重比较矫正 |
张韬 |
晚上 |
课程总结、复习及答疑 |
任务态数据分析小结、复习及答疑 |
静息态数据分析小结、复习及答疑 |
弥散张量成像数据分析小结、复习及答疑 |
3月27日 |
第5天 |
张韬 |
上午 |
功能连接及FCD、FCS |
基于种子点功能连接原理介绍 |
FCD、FCS原理及实操 |
REST Viewer的使用及作图注意事项 |
张韬 |
下午 |
结果汇报及常用工具 |
表格制作及脑区汇报注意事项 |
BrainNet:基于皮层的脑图制作 |
脑影像数据与临床指标的相关分析 |
实用小工具及相关使用 |
孙家伟 |
晚上 |
格兰杰因果分析(GCA) |
GCA概念和原理介绍 |
Blind deconvolution原理推导和实操 |
GCA实操和结果呈现 |
3月28日 |
第6天 |
臧玉峰 |
上午 |
研讨会及Meta分析 |
静息态功能磁共振概述及其在认知与脑疾病的应用前景 |
贾熙泽 |
脑影像Meta分析介绍 |
ALE算法原理及操作解读 |
贾熙泽 |
下午 |
文章撰写的注意事项 |
磁共振实验设计及数据采集注意事项 |
数据分析指标在文章中的应用及常见问题 |
范文解读及文章撰写常见注意事项 |
备注:请各位学员
自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。
请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统。
4. 授课教师
臧玉峰:医学博士。杭州师范大学心理科学研究院执行院长。1984年于河北医学院获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位、2002年于北京大学精神卫生研究所获儿童精神卫生博士学位。曾经从事临床神经外科工作14年,之后在中科院自动化所模式识别国家重点实验室、北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室以及杭州师范大学工作。近年来主要从事静息态功能磁共振影像的计算方法学及其在认知与脑疾病的应用研究。与同事提出“局部一致性”和“低频振幅”等方法。带领研究团队开发了REST、DPARSF、RESTplus等软件。合作发表英语论文100多篇,Google Scholar数据库引用21319次(h指数64)。2014到2018年连续5年入选Elsevier“中国高被引学者”(神经科学),2017、2018年入选Clarivate 高被引学者(神经与行为科学)。
王春杰:博士,于2017年9月在浙江大学物理系获得博士学位,之后在浙江大学光电系从事博士后研究工作,现为杭州师范大学教育学院心理特教系讲师。主要应用行为学、功能磁共振和脑电等技术研究儿童认知功能的发展规律及其脑机制、认知训练对儿童认知功能和大脑发育的影响等。获得国家自然科学基金青年项目和中国博士后科学基金资助。合作发表SCI论文12篇,其中以第一作者在Journal of Neurosicence, NeuroImage和Human Brain Mapping等期刊发表论文5篇。
贾熙泽:杭州脑海科技有限公司首席执行官,杭州师范大学助理研究员,中国心理学会积极心理学专委会委员,具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。目前主持国自然青年基金项目1项,并作为主要参与人参与多项国自然科学基金项目。主要研究方向为静息态功能磁共振方法学、脑影像Meta分析以及静息态数据分析软件开发。2013年起负责维护REST系列工具包,并开发了RESTplus,该软件的论文目前已发表于Science Bulletin(影响因子 9.5分)。静息态功能磁共振论坛(
http://www.restfmri.net)管理员。合作发表SCI文章19篇,其中主要作者9篇(第一作者或通讯作者)。Frontiers in Neuroscience(SCI医学2区,3年平均IF 3.69)、Frontiers in Psychology(SSCI心理学2区期刊,影响因子2.0)以及Frontiers in Psychiatry(SCI医学3区,3年平均IF 3.18)杂志的评审编辑,Journal of Magnetic Resonance Imaging、Frontiers Aging Neuroscience、Neural Plasticity、Scientific Report等多个杂志的审稿人,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析。
张韬:脑海科技高级数据分析工程师
黄国峰:脑海科技高级数据分析工程师
5. 培训说明
培训班限额招生20人,报满截止。
我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。
6. 培训费用
费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人3500元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,
支付宝账号:19941364880,杨会云。
7. 培训地点
培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼10楼,脑海科技第3会议室。
8. 报名方式
请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。
9. 联系方式
电话咨询:黄国峰 180 7298 0399
微信咨询:黄国峰 180 7298 0399
报名回执表
单位名称(发票抬头,纳税人识别号) |
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发票类型(会议费/培训费) |
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姓名 |
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性别 |
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电话号码 |
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微信 |
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科室/专业 |
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研究方向 |
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银行信息 |
户名:杭州脑海科技有限公司
账号:3301040160015883146
开户行:杭州银行萧山支行 |
汇款备注 |
第16期小班 |
10. 在线支持服务
脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。