第20期小班:动态脑网络及有向脑网络数据分析专题培训
2021.05.25-2021.05.30(周二~周日)
主办单位:杭州脑海科技有限公司
协办单位:杭州师范大学心理科学研究院
1. 内容概括
1) 本期培训班在杭州举办为期6天(05月25日-05月30日)
2) 内容涵盖:
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机器学习简介(分类、聚类、回归、特征提取、交叉验证等)
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基于LASSO的脑网络构建(基于LASSO、组LASSO的脑网络构建)
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个体形态学网络构建
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基于DynamicBC构建时变脑功能网络:滑动窗法和FLS方法
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动态脑网络统计分析:频谱、聚类分析
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血液动力学去卷积
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双变量/部分条件/多变量Granger Causality分析
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rsHRF构建有向脑网络 (NIfTI, GIfTI或txt/mat文件)
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有向脑网络统计分析
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独立成分分析(ICA)
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多重比较校正及双因素方差分析
2. 课程说明
大脑是一个在结构上和功能上都存在广泛相互连接的复杂网络,为了更清楚地揭示脑的工作机理,功能磁共振成像近年来凭借其非侵入性、无辐射的优势被广泛应用于脑科学的研究中。近年来,神经科学家们充分认识到了构建人脑网络的重要性,探究大脑网络连接关系为窥探大脑内部的神经活动规律以及各种神经精神疾病的发病机理等重大神经科学问题提供全新的视角。大脑在感知世界的过程中经历着信息感知、传递、协调、变换、存储以及新信息生成等一系列信息处理过程,大脑的功能活动状态随之发生相应的变化,为了分析大脑活动的动态变化,近年来静息态功能磁共振提出了一系列的动态分析方法。
为了帮助大家更快速地掌握脑网络动态指标及相关的数据分析方法,我们拟举办一期以Dynamic为特色的数据分析培训班,
我们邀请了开发Dynamic BC工具包的作者吴国榕博士授课,考虑到近年来,越来越多的研究构建个体水平的结构网络并且机器学习算法在脑影像的应用越发广泛,
我们邀请了李伟凯老师讲解个体水平的结构网络构建以及机器学习算法。本课程为期6天,为确保大家在6天内可以充分的掌握内容,我们承诺:
每期都会根据学员人数安排充足的助教,保证手把手指导分析数据(注:脑海科技团队一共拥有10余人的助教)。希望协助磁共振成像的科研工作者快速掌握相关的分析原理以及方法,以便能够应用到相关的研究领域中。
注:请提前一天到会场2021年05月24日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。
3. 课程安排
5月25日
第1天 |
静息态功能磁共振概述 |
上午 |
臧玉峰 |
静息态功能磁共振概述及其在认知与脑疾病的应用前景 |
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数据采集注意事项 |
贾熙泽 |
脑影像数据采集注意事项 |
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基于体素的形态学分析 |
下午 |
张韬 |
基于体素的形态学分析:原理及应用 |
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横向数据以及纵向数据的形态学分析方法 |
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CAT12软件的应用介绍以及形态学指标的计算 |
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基于体素的形态学分析的统计方法介绍与实操 |
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编程入门 |
晚上 |
李仔麒 |
MATLAB基础语法 |
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MATLAB编程初步及实操 |
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5月26日
第2天 |
机器学习算法介绍及实操 |
上午 |
李伟凯 |
机器学习简介(分类、聚类、回归、特征提取、交叉验证等) |
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LASSO简介及其应用(SLEP工具包:稀疏、弹性网、组LASSO) |
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基于LASSO的脑网络构建(基于LASSO、组LASSO的脑网络构建) |
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支持向量机简介及其应用(一致性连接、ROC曲线、SVR、lib-svm等) |
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个体形态学网络 |
下午 |
个体形态学网络构建 |
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图论属性介绍及实操(gretna) |
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多模态学习(多核-支持向量机介绍) |
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功能像数据整理 |
晚上 |
张韬 |
静息态功能磁共振数据整理介绍 |
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静息态功能磁共振数据整理常见报错 |
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5月27日
第3天 |
静息态数据预处理 |
上午 |
贾熙泽 |
静息态数据预处理原理 |
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静息态数据预处理常见问题 |
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静息态数据分析指标入门 |
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静息态指标入门 |
下午 |
张韬 |
静息态预处理实操 |
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静息态局部指标介绍 |
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静息态功能连接介绍 |
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Dynamic方法入门 |
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Dynamic入门 |
晚上 |
张韬 |
Dynamic ALFF、fALFF、ReHo原理及实操 |
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Dynamic degree centrality原理及实操 |
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5月28日
第4天 |
动态脑功能网络构建和分析 |
上午 |
吴国榕 |
动态脑功能网络分析简介 |
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基于DynamicBC构建时变脑功能网络(滑动窗法) |
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下午 |
基于DynamicBC构建时变脑功能网络(FLS方法) |
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动态脑网络统计分析:频谱、聚类分析(上机操作) |
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独立成分分析 |
晚上 |
张韬 |
独立成分分析(ICA)原理介绍 |
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ICASSO介绍 |
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GIFT上机实操 |
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5月29日
第5天 |
有向脑网络构建和分析 |
上午 |
吴国榕 |
有向连接分析简介 |
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血液动力学去卷积 |
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双变量/部分条件/多变量Granger Causality分析 |
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下午 |
rsHRF构建有向脑网络 (NIfTI, GIfTI或txt/mat文件) (上机操作) |
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有向脑网络统计分析 (上机操作) |
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复习与小节 |
晚上 |
张韬 |
Dynamic BC复习课 |
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5月30日
第6天 |
T检验及多重比较校正 |
上午 |
张韬 |
多元线性回归模型介绍 |
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统计检验(T检验) |
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多重比较校正介绍 |
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FDR、FWE、GRF、AlphaSim及TFCE介绍与实操 |
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方差分析以及结果呈现 |
下午 |
单因素方差分析(多组、重复测量) |
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双因素方差分析 |
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结果呈现与表格制作 |
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BrainNet作图 |
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备注:请各位学员
自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。
请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统。
4. 授课教师
臧玉峰:医学博士。杭州师范大学心理科学研究院执行院长。1984年于河北医学院获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位、2002年于北京大学精神卫生研究所获儿童精神卫生博士学位。曾经从事临床神经外科工作14年,之后在中科院自动化所模式识别国家重点实验室、北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室以及杭州师范大学工作。近年来主要从事静息态功能磁共振影像的计算方法学及其在认知与脑疾病的应用研究。与同事提出“局部一致性”和“低频振幅”等方法。带领研究团队开发了REST、DPARSF、RESTplus等软件。合作发表英语论文100多篇,Google Scholar数据库引用21319次(h指数64)。2014到2018年连续5年入选Elsevier“中国高被引学者”(神经科学),2017、2018年入选Clarivate 高被引学者(神经与行为科学)。
吴国榕:博士,副研究员。主要关注神经影像数据的动态脑功能分析算法,以及无创脑刺激在临床治疗上的脑神经机制。相关文章发表在Medical Image Analysis,NeuroImage, Brain Stimulation等学术期刊上。开发了rsHRF, DynamicBC和Brain GPS等数据分析软件。目前主持一项国自然面上项目,已完成一项国自然青年项目。
李伟凯:南京航空航天大学博士生在读,主要研究方向为机器学习,多模态脑影像分析以及脑网络连接组学。IEEE TASE,IEEE JBHI,Frontiers in neuroscience 以及Frontiers in Aging neuroscience 等期刊以及MICCAI、 PRCAI等会议的审稿人,以第一作者,共同一作以及通信作者在human brain mapping、IEEE JBHI 、Frontiers in Aging Neuroscience等期刊发表文章7篇。
贾熙泽:杭州脑海科技有限公司首席执行官,杭州师范大学助理研究员,中国心理学会积极心理学专委会委员,具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。目前主持国自然青年基金项目1项,并作为主要参与人参与多项国自然科学基金项目。主要研究方向为静息态功能磁共振方法学、脑影像Meta分析以及静息态数据分析软件开发。2013年起负责维护REST系列工具包,并开发了RESTplus,该软件的论文目前已发表于Science Bulletin(影响因子 9.5分)。静息态功能磁共振论坛(
http://www.restfmri.net)管理员。合作发表SCI文章20篇,其中主要作者10篇(第一作者或通讯作者)。Frontiers in Neuroscience(SCI医学2区,3年平均IF 3.69)、Frontiers in Psychology(SSCI心理学2区期刊,影响因子2.0)以及Frontiers in Psychiatry(SCI医学3区,3年平均IF 3.18)杂志的评审编辑,Journal of Magnetic Resonance Imaging、Frontiers Aging Neuroscience、Neural Plasticity、Scientific Report等多个杂志的审稿人,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析。
张韬:脑海科技高级数据分析工程师
5. 培训说明
培训班限额招生20人,报满截止。
我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。
6. 培训费用
费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人3500元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,
支付宝账号:19941364880,杨会云。
7. 培训地点
培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼10楼,脑海科技第3会议室。
8. 报名方式
请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。
9. 联系方式
电话咨询:黄国峰 180 7298 0399
微信咨询:黄国峰 180 7298 0399
报名回执表
单位名称(发票抬头) |
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纳税人识别号(税号) |
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发票类型(会议费/培训费) |
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科室/专业 |
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研究方向 |
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银行信息 |
户名:杭州脑海科技有限公司
账号:3301040160015883146
开户行:杭州银行萧山支行 |
汇款备注 |
第20期小班 |
10. 在线支持服务
脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。