第33期：脑白质功能网络构建及拓扑属性分析专题培训班
2021.11.12 -2021.11.17（周五 ~周三）
主办单位：杭州脑海科技有限公司
协办单位：杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心
杭州拾睿科技有限公司
1. 课程说明
功能磁共振成像近年来凭借其非侵入性、无创的优势被广泛应用于脑科学的研究中。使用静息态功能磁共振成像(fMRI)通常在灰质中探索大脑功能。随着脑科学的飞速发展，最新的研究发现，在静息状态下，白质的低频BOLD-fMRI波动呈现出一种特定的分布，而非随机的噪声。虽然DTI已被广泛的应用于研究脑内白质纤维束结构，但它不能揭示白质的功能活动。最近，白质功能活动在逐渐被重视起来，并发表了一系列十分有影响力的文章，已发表的文章提示我们可以从白质功能网络结合复杂网络方法角度出发，从而增强对异常脑功能网络的解释力度，对相关研究问题进行更深入的讨论。
目前，白质功能网络是一个比较有前景的新方向，值得进一步的深入研究，很多重要的脑疾病还没有深入探索脑白质功能网络连接异常。为了帮助大家更快速地掌握白质BOLD信号的数据分析方法，我们拟举办一期以分析白质BOLD信号为特色的数据分析培训班，我们邀请了该领域的专家廖伟教授以及李娇博士授课。课程为期6天，兼具原理、操作与文章写作、作图等全程教授，为确保大家在6天内可以充分的掌握内容。我们承诺：
每期都会根据学员人数安排充足的助教，保证手把手指导分析数据（注：脑海科技团队一共拥有10余人的助教）。希望我们的课程可以协助磁共振成像的科研工作者快速掌握相关的分析原理以及方法。
注：请提前一天到会场2021年11月11日（13:30 - 20:00）安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。
2.课程安排
第1天
11月
12日
周五 |
臧玉峰
张韬 |
[上午]
静息态概述及课程体系介绍 |
9：00-12：00 |
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静息态、任务态及相关技术 |
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脑白质功能数据分析入门介绍 |
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培训班课程体系介绍 |
贾熙泽
张韬 |
[下午]
白质相关预处理基本概念与操作 |
14:00-17:00 |
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静息态相关技术及多重比较校正 |
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脑白质功能数据预处理介绍 |
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脑白质功能数据预处理实操 |
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数据质量控制与软件常见报错 |
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张韬 |
[晚上]
白质功能数据分析准备工作 |
18:00-21:30 |
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白质功能信号提取流程介绍 |
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脑白质功能信号处理注意事项 |
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脑白质功能信号处理实际操作 |
第2天
11月
13日
周六 |
张韬 |
[上午]
白质功能指标计算（局部） |
9：00-12：00 |
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基于白质功能信号的局部指标计算介绍 |
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基于白质功能信号的局部指标软件操作 |
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基于白质功能信号的局部指标相关问题解读 |
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实操上机 |
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张韬 |
[下午]
白质功能指标计算（局部）
统计分析 |
14:00-17:00 |
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统计检验理论+实操 |
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多重比较校正介绍 |
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FDR、FWE原理及实操 |
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TFCE原理及实操 |
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GRF、AlphaSim原理及实操 |
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李仔麒 |
[晚上]
实操复习 |
18:00-19:20 |
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自由练习与问题答疑 |
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19:30-21:30 |
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实操复习白天内容 |
第3天
11月
14日
周日 |
廖伟 |
[上午]
人脑连接体网络介绍 |
9：00-12：00 |
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人脑连接体网络：从单模态到多模态 |
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人脑连接体网络：从静态到动态 |
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人脑连接体网络：从灰质到白质 |
[下午]
关于跨尺度脑影像研究方法 |
14:00-17:00 |
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跨尺度脑影像研究方法介绍 |
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关于跨尺度抑郁症脑成像研究解读 |
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脑成像与来自基因表达的证据 |
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王晴 |
[晚上]
基础作图 |
18:00-21:30 |
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DynamicBC作图实操 |
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Graphpad7作图实操 |
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Mricron, BrainNet制图工具讲解与实操 |
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结果图类型与制图工具选取总结 |
第4天
11月
15日
周一 |
李娇 |
[上午]
脑白质网络构建（图论的基本概念） |
9：00-12：00 |
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图论的基本概念和原理 |
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脑白质功能网络构建方法介绍 |
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基于白质脑网络的稀疏矩阵构建 |
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基于白质脑网络的稀疏矩阵构建实操 |
[下午]
脑白质网络的拓扑属性（非参数统计，相关，作图） |
14:00-17:00 |
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白质的网络拓扑属性讲解 |
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脑白质功能拓扑属性非参数统计方法 |
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白质脑功能网络拓扑性与临床量表的相关 |
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脑白质功能拓扑属性作图讲解 |
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张韬 |
[晚上]
复习 |
18:00-19:20 |
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自由练习与问题答疑 |
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19:30-21:30 |
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实操复习白天内容 |
第5天
11月
16日
周二 |
李娇 |
[上午]
作图进阶 |
9：00-12：00 |
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脑白质功能网络可视化简介 |
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脑白质文章结果图组合技巧讲解 |
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脑白质文章结果图组合的绘制与实操 |
[下午]
文章的写作，解读以及审稿 |
14:00-17:00 |
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脑白质文章精细解读 |
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脑白质文章写作整体思路与流程 |
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脑白质文章写作注意事项 |
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对脑白质功能网络的结果和意义解读 |
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脑白质功能论文审稿常见问题 |
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张韬 |
[晚上]
实操复习 |
18:00-19:20 |
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自由练习与问题答疑 |
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19:30-21:30 |
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实操复习白天内容 |
第6天
11月
17日
周三 |
孙家伟 |
[上午]
SVM及SVR原理简介 |
9：00-12：00 |
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机器学习简单介绍及应用 |
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支持向量机（SVM）原理介绍 |
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支持向量机回归（SVR）原理介绍 |
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核技巧与核函数 |
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多种方式构建特征空间 |
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孙家伟 |
[下午]
Libsvm实操 |
14:00-17:00 |
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基于Libsvm的SVM分类实操 |
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SVM的交叉验证方法实操 |
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SVM的参数调优实操 |
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SVM分类模型的评价指标与参数调优可视化 |
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基于Libsvm的SVR回归预测分析 |
备注：请各位学员
自带笔记本电脑，建议电脑配置：windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。
请尽量携带Windows电脑，如果只能使用苹果MAC电脑，请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统。
3. 授课教师
臧玉峰：医学博士，杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心主任，浙江省认知障碍评估技术研究重点实验室主任。1984于年河北医学院获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位（导师薛庆澄教授）、2002年于北京大学精神卫生研究所获精神病学博士学位（导师王玉凤教授）。曾经从事临床神经外科工作14年，2002年至今先后在中科院自动化所模式识别国家重点实验室、北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室以及杭州师范大学工作。主要从事静息态功能磁共振计算方法及其在认知与脑疾病的应用研究。提出“局部一致性”和“低频振幅”等方法。带领研究团队开发了REST、DPARSF、REST-GCA、RESTplus等软件。合作发表论文100多篇，被引用近30,000次（谷歌学术），有5篇主要作者论文被引用1181-2465次。共同领导多个国际多中心静息态功能磁共振合作研究。2014到2020年连续7年入选Elsevier“中国高被引学者”（神经科学、心理学），2017、2018年入选Clarivate 高被引学者（神经与行为科学）。
廖伟：电子科技大学生命科学与技术学院，教授，博导。电子科技大学神经信息教育部重点实验室骨干研究人员。获四川省杰出青年。2005年开始攻读硕博学位，师从国家杰出青年基金获得者陈华富教授。近年来共发表SCI论文81篇，总引2825次（SCI他引2262次）；其中。论文包括电子信息领域：Nature Communications（1篇），IEEE Transactions on Medical Imaging（3篇）和International Journal of Neural Systems（1篇）；综合期刊：Science Bulletin（2篇）；脑成像领域：Brain（1篇），Schizophrenia Bulletin（1篇），Radiology（2篇），NeuroImage（3篇）和Human Brain Mapping（5篇）等期刊，其中一区刊物13篇。他引源包括Nature Reviews Neuroscience, Nature Reviews Neurology, Lancet Neurology, Physics Reports, Trends in Neurosciences和PNAS等国际顶级期刊。主持国家自然科学基金3项；参编英文专著1本；获计算机软件著作权2项；授权发明专利1项、申请发明专利2项。研究成果发现癫痫典型脑影像特征，从时间和空间角度发展脑动态网络分析方法，揭示癫痫活动信息传递和网络的演化；建立智能化癫痫活动，癫痫灶定位和多模态脑影像信息模式识别和预测模型的关键理论和方法，为临床服务。
李娇：电子科技大学2021年博士毕业生。于2015年获电子科技大学工学学士学位，先后以保研和硕博连读方式攻读博士学位，师从国家级青年人才廖伟教授。博士期间，以唯一第一作者或2S（导师第一）作者发表SCI论文7篇，其中IF>5论文5篇，中科院一区论文5篇。发表期刊包括：综合期刊（Nature Communications, IF=12.121），电子信息领域（IEEE Transactions on Medical Imaging, IF=6.685），精神病学（Psychological Medicine, IF=5.811, Translational Psychiatry, IF=5.280）等。他引源包括American Journal of Psychiatry（IF=14.251），Brain（IF=11.337），IEEE Transactions on Medical Imaging等国际顶刊；并被美国工程院院士，IEEE会士等正面引用评价。申请人参与国家自然科学基金1项，省部级项目2项。研究成果证实脑白质功能信息的存在性，提出脑白质功能网络构建方法，建立脑白质功能预测模型，从不同的维度揭示抑郁症脑网络异常表征；建立脑影像和基因表达融合模型，揭示抑郁症脑网络表征和特定基因、细胞类别以及生物通路的关系。
贾熙泽：杭州脑海科技有限公司首席执行官，杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心副研究员（兼职）。研究兴趣为：静息态方法学、基于脑影像的Meta分析以及脑影像技术在积极心理学中的应用。现任中国心理学会积极心理学专委会委员，师从任俊教授从事积极心理学研究。具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。目前主持国自然青年基金项目1项，并作为主要参与人参与8项国自然科学基金项目。在臧玉峰教授的指导下，基于REST开发了RESTplus工具包，有关该工具包的论文于2019年发表于Science Bulletin（影响因子 9.5分，30次引用）。同时还担任静息态功能磁共振论坛网站（restfmri.net）的管理员。合作发表SCI文章23篇，主要作者13篇（第一作者或通讯作者）。Neural Plasticity杂志的guest editor、Frontiers in Neuroscience（SCI医学2区，3年平均IF 3.69）、Frontiers inPsychology（SSCI心理学2区期刊，影响因子2.0）以及Frontiers inPsychiatry（SCI医学3区，3年平均IF 3.18）杂志的评审编辑，Journal of Magnetic Resonance Imaging、Frontiers Aging Neuroscience、Brain research、Neuroimage：Report、Scientific Report等多个杂志的审稿人，曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析。
张韬：脑海科技高级数据分析工程师
李仔麒：脑海科技高级数据分析工程师
孙家伟：脑海科技高级数据分析工程师
王晴：脑海科技高级数据分析工程师
4. 培训说明
培训班限额招生20人，报满截止。
我们会按照缴费顺序安排座位，为方便会务安排，报名敬请从速。考虑到疫情原因，本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码（支付宝首页搜索‘杭州健康码’）。
5. 培训费用
费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心，交通及住宿费用自理，每人3500元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡，培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款，
支付宝账号：19941364880，杨会云。
6. 培训地点
培训地点：浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼10楼，脑海科技第3会议室。
7. 报名方式
请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com，我们会联系您。
8. 联系方式
电话咨询：188 6874 4976
微信咨询：188 6874 4976
报名回执表
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纳税人识别号（税号） |
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发票类型（会议费/培训费） |
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科室／专业 |
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研究方向 |
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银行信息 |
户名：杭州脑海科技有限公司
账号：3301040160015883146
开户行：杭州银行萧山支行 |
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汇款备注 |
第33期小班 |
9. 在线支持服务
脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务，确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。
