培训课程
第05期:多角度解析静息态脑瞬态活动-基础训练营
2021.12.15-2021.12.19(周三 ~周日)
主办单位:杭州脑海科技有限公司
协办单位:杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心
杭州拾睿科技有限公司
1. 课程说明
目前,通过利用功能磁共振成像技术,研究者们充分认识到了脑区之间的相互连接关系能够为脑异常活动、发育以及老化提供重要信息。传统的功能连接(Functional connectivity, FC)方法提高了我们对大脑功能结构以及功能的理解,特别是在静息状态中,发现了大量关于脑宏观时空组织模式,取得了一系列进展。在传统FC的评估中,我们默认在扫描过程中信号是具有时间平稳性的。然而研究表明,静息状态下的fMRI信号是具有动态特性的。动态连接自提出以来,也引起了研究者们的广泛兴趣,例如通过滑动窗技术在静息态下发现在不同窗的动态连接模式;共激活模式利用少数时间点进行动态分析;隐马尔科夫则以马尔可夫链的形式对脑状态的动态切换进行建模。
为了帮助大家更快速地掌握各种dynamic相关技术,我们拟举办一期专门针对dynamic的数据分析培训班,内容涵盖:静息态常见local指标的dynamic分析、滑动窗与FLS技术、共激活模式分析、隐马尔科夫模型等,此外,课程内容还添加了适用于dynamic技术的统计分析方法。
本课程为期5天,为确保大家在5天内可以充分的掌握内容,我们承诺:每期都会根据学员人数安排充足的助教,保证手把手指导分析数据(注:脑海科技团队一共拥有10余人的助教)。希望协助刚刚接触磁共振成像的科研工作者快速掌握功能磁共振的数据分析原理以及方法,以便能够应用到相关的研究领域中。本次培训面向神经内科、精神科(心理科)、放射科、康复科、消化科、儿科等科室的临床医生,以及各大高校从事脑科学研究的生物医学工程、计算机、数学等专业的研究人员。本次培训班兼具原理与操作,相信5天的学习定会对学员有所助益。
注:请提前一天到会场2021年12月14日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。
2. 课程安排
第1天 12月15日 周三 |
高艳艳 |
[上午] 基于滑动窗的Dynamic指标 |
9:00-12:00 |
Dynamic发展及优势介绍 | |||
静息态数据预处理介绍 | |||
Dynamic FC、ALFF原理讲解 | |||
滑动窗方法原理及窗参选择 | |||
[下午] Dynamic指标实操及结果呈现 |
14:00-17:00 | ||
Dynamic预处理及指标计算 | |||
统计检验实操 | |||
多重比较校正实操 | |||
结果呈现与表格制作 | |||
RESTplus作图实操 | |||
胡素 |
[晚上] 复习 |
18:00-21:00 | |
复习白天内容 | |||
第2天 12月16日 周四 |
王晴 |
[上午] 基于FLS的Dynamic FC |
9:00-12:00 |
dynamic常用方法介绍 | |||
FLS方法解析 | |||
基于FLS计算的dFC操作 | |||
不同水平的的FLS分析实操 | |||
[下午] 基于FLS结果统计分析 |
14:00-17:00 | ||
FLS生成结果讲解 | |||
dFC强度指标的统计分析 | |||
dFC变异指标的统计分析 | |||
高艳艳 |
[晚上] 复习 |
18:00-21:00 | |
复习白天内容 | |||
第3天 12月17日 周五 |
王晴 |
[上午] 聚类分析 |
9:00-12:00 |
K-均值聚类介绍 | |||
最优K值的选取及实操 | |||
聚类结果解析 | |||
[下午] 基于聚类的相关指标 |
14:00-17:00 | ||
聚类结果的呈现及意义 | |||
时间参数的计算 | |||
聚类结果指标的统计分析 | |||
高艳艳 |
[晚上] 复习 |
18:00-21:00 | |
复习白天内容 | |||
第4天 12月18日 周六 |
贾熙泽 李杰 |
[上午] 静息态相关技术与共激活模式介绍 |
9:00-12:00 |
静息态功能磁共振相关技术及文章撰写注意事项 | |||
共激活模式原理介绍 | |||
共激活模式的构建 | |||
李杰 |
[下午] 共激活模式相关指标计算 |
14:00-17:00 | |
状态空间模式呈现 | |||
共激活状态的时间动态特性指标计算 | |||
时间动态特性指标的统计分析 | |||
李杰 李梦婷 |
[晚上] 结果呈现及复习 |
18:00-21:00 | |
指标统计结果呈现 | |||
复习白天内容 | |||
第5天 12月19日 周日 |
李杰 |
[上午] 隐马尔科夫模型原理及构建 |
9:00-12:00 |
隐马尔科夫模型HMM原理简介 | |||
隐状态的构建 | |||
最佳隐状态的选取 | |||
[下午] 隐状态指标计算 |
14:00-17:00 | ||
隐状态平均激活呈现 | |||
隐状态时间动态特性指标计算 | |||
指标统计分析及结果呈现 |
备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统。
3. 基础训练营授课团队介绍
基础训练营相关课程由杭州脑海科技有限公司自主研发设计,紧跟当下研究热点和研究趋势,致力于为学习者提供最全面最先进的技术,努力打造适合不同阶段学习者的课程,尽可能满足不同水平学员的需求。
脑海科技是一家专注于医学脑影像课程设计、算法研发及数据分析的科技公司。首席执行官贾熙泽兼任杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心副研究员,并担任中国心理学会积极心理学专委会委员和浙江省数理医学学会放射学专委会委员。具有计算机、心理学及神经科学交叉背景,擅长静息态磁共振方法学、基于脑影像的Meta分析,并师从任俊教授从事脑影像技术在积极心理学中的应用。目前主持国家自然科学青年基金项目1项,并作为主要合作者参与8项国自然科学基金项目。在臧玉峰教授的指导下,基于REST开发了RESTplus工具包,相关论文于2019年发表于Science Bulletin(影响因子 9.5分,40次引用)。
脑海科技有限公司于2021年组建了脑海科技有限公司认知神经科学实验室,主要从事最新脑影像算法的复现、研发及在脑疾病中的应用。基础训练营授课教师均来自脑海科技有限公司认知神经科学实验室,目前团队成员30余人,具有高度交叉背景,涵盖:计算机、统计学、心理学、临床医学以及英语等专业,每位成员受过系统化的科研培训,具有扎实的科研背景并专攻1-2个研究方向。2021年1月至今,实验室成员以主要作者在Science Bulletin、Human brain mapping、Journal of Affective Disorders等期刊发表SCI文章12篇(含接收),实验室核心成员具有比较扎实的科研基础,担任多个杂志的编辑或审稿人,包括:Science Bulletin、Neuroimage、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、Neuroimage: Clinical、Neuroimage: Report、Journal of Magnetic Resonance Imaging、Frontiers in Aging Neuroscience、Brain research、Neural Plasticity、Frontiers in Neuroscience、 Scientific Report等。
4. 培训说明
培训班限额招生15人,报满截止。我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。
5. 培训费用
费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人2900元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:19941364880,杨会云。
6. 培训地点
培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼10楼,脑海科技第3会议室。
7. 报名方式
请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。
8. 联系方式
电话咨询:188 6874 4976
微信咨询:188 6874 4976
报名回执表
单位名称(发票抬头) | |
纳税人识别号(税号) | |
发票类型(会议费/培训费) | |
姓名 | |
性别 | |
电话号码 | |
微信 | |
科室/专业 | |
研究方向 | |
银行信息 |
户名:杭州脑海科技有限公司 账号:3301040160015883146 开户行:杭州银行萧山支行 |
汇款备注 | 第05期训练营 |
9. 在线支持服务
脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。