培训课程
第06期:基于图论的拓扑指标及其形态学分析-基础训练营
2021.12.22-2021.12.26(周三 ~周日)
主办单位:杭州脑海科技有限公司
协办单位:杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心
杭州拾睿科技有限公司
1. 课程说明
人脑是一个在结构上和功能上都存在相互连接的复杂网络,功能磁共振成像近年来凭借其非侵入性、无辐射的优势被广泛应用于脑科学的研究中。
目前,神经科学家们已正式提出人脑连接组的概念,以期唤起不同领域的广大科研工作者对该问题的重视。复杂网络目前已被应用于探究脑网络的基本属性以及脑区间潜在的拓扑关系,从而为窥探人脑内部的神经活动规律以及各种神经精神疾病的发病机理等重大神经科学问题提供全新的视角。为了帮助大家更快速地掌握相关的分析技术,我们拟举办一期专门针对关于脑网络功能与结构的数据分析培训班。本期内容涵盖:结构协变网络、形态学分析、DTI跨模态分析、DTI纤维追踪等。
本课程为期5天,为确保大家在5天内可以充分的掌握内容,我们承诺:每期都会根据学员人数安排充足的助教,保证手把手指导分析数据(注:脑海科技团队一共拥有10余人的助教)。希望协助刚刚接触磁共振成像的科研工作者快速掌握功能磁共振的数据分析原理以及方法,以便能够应用到相关的研究领域中。本次培训面向神经内科、精神科(心理科)、放射科、康复科、消化科、儿科等科室的临床医生,以及各大高校从事脑科学研究的生物医学工程、计算机、数学等专业的研究人员。本次培训班兼具原理与操作,相信5天的学习定会对学员有所助益。
注:请提前一天到会场2021年12月21日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。
2. 课程安排
第1天 12月 22日 周三 |
张韬 |
[上午] 功能连接 |
9:00-12:00 |
功能连接介绍 | |||
图论基础知识 | |||
脑连接组学计算方法与应用 | |||
人脑复杂网络分析流程 | |||
[下午] 功能网络构建 |
14:00-17:00 | ||
静态功能连接网络构建 | |||
动态功能连接网络构建 | |||
GRETNA操作练习 | |||
总结与答疑 | |||
文建洁 |
[晚上] 复习 |
18:00-21:00 | |
复习白天内容 | |||
第2天 12月 23日 周四 |
张韬 |
[上午] 拓扑指标计算与统计 |
9:00-12:00 |
拓扑指标介绍与计算 | |||
拓扑指标统计分析 | |||
多重比较校正 | |||
GRETNA操作练习 | |||
[下午] 脑连接组可视化 |
14:00-17:00 | ||
Brain Network的可视化 | |||
BrainNet Viewer介绍 | |||
BrainNet Viewer操作练习 | |||
总结与答疑 | |||
文建洁 |
[晚上] 复习 |
18:00-21:00 | |
复习白天内容 | |||
第3天 12月 24日 周五 |
黄国峰 |
[上午] 结构协变网络原理介绍与构建 |
9:00-12:00 |
结构协变网络原理详解 | |||
结构协变网络实例介绍 | |||
结构协变网络构建 | |||
[下午] 结构协变网络实操 |
14:00-17:00 | ||
结构协变网络统计 | |||
结构协变网络制图 | |||
小结 | |||
王倩倩 |
[晚上] 复习 |
18:00-21:00 | |
复习白天内容 | |||
第4天 12月 25日 周六 |
贾熙泽 孙家伟 |
[上午] 静息态相关技术与形态学分析 |
9:00-12:00 |
静息态功能磁共振相关技术及文章撰写注意事项 | |||
基于体素的形态学分析原理及应用 | |||
基于体素的形态学分析实操 | |||
孙家伟 |
[下午] 个体形态学脑网络的构建 |
14:00-17:00 | |
形态学指标与临床指标的相关性分析 | |||
个体形态学脑网络的构建原理 | |||
孙家伟 王倩倩 |
[晚上] 实操与复习 |
18:00-21:00 | |
个体形态学脑网络的构建实操 | |||
复习白天内容 | |||
第5天 12月 26日 周日 |
李仔麒 |
[上午] DTI |
9:00-12:00 |
DTI数据预处理 | |||
FA、MD等指标分析 | |||
基于voxel水平的统计分析 | |||
[下午] 纤维追踪和跨模态分析 |
14:00-17:00 | ||
确定性纤维追踪介绍与实操 | |||
功能像与DTI图像的联合分析介绍 | |||
功能像与DTI图像的联合分析实操 |
备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统。
3. 基础训练营授课团队介绍
基础训练营相关课程由杭州脑海科技有限公司自主研发设计,紧跟当下研究热点和研究趋势,致力于为学习者提供最全面最先进的技术,努力打造适合不同阶段学习者的课程,尽可能满足不同水平学员的需求。
脑海科技是一家专注于医学脑影像课程设计、算法研发及数据分析的科技公司。首席执行官贾熙泽兼任杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心副研究员,并担任中国心理学会积极心理学专委会委员和浙江省数理医学学会放射学专委会委员。具有计算机、心理学及神经科学交叉背景,擅长静息态磁共振方法学、基于脑影像的Meta分析,并师从任俊教授从事脑影像技术在积极心理学中的应用。目前主持国家自然科学青年基金项目1项,并作为主要合作者参与8项国自然科学基金项目。在臧玉峰教授的指导下,基于REST开发了RESTplus工具包,相关论文于2019年发表于Science Bulletin(影响因子 9.5分,40次引用)。
脑海科技有限公司于2021年组建了脑海科技有限公司认知神经科学实验室,主要从事最新脑影像算法的复现、研发及在脑疾病中的应用。基础训练营授课教师均来自脑海科技有限公司认知神经科学实验室,目前团队成员30余人,具有高度交叉背景,涵盖:计算机、统计学、心理学、临床医学以及英语等专业,每位成员受过系统化的科研培训,具有扎实的科研背景并专攻1-2个研究方向。2021年1月至今,实验室成员以主要作者在Science Bulletin、Human brain mapping、Journal of Affective Disorders等期刊发表SCI文章12篇(含接收),实验室核心成员具有比较扎实的科研基础,担任多个杂志的编辑或审稿人,包括:Science Bulletin、Neuroimage、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、Neuroimage: Clinical、Neuroimage: Report、Journal of Magnetic Resonance Imaging、Frontiers in Aging Neuroscience、Brain research、Neural Plasticity、Frontiers in Neuroscience、 Scientific Report等。
4. 培训说明
培训班限额招生15人,报满截止。我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。
5. 培训费用
费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人2900元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:19941364880,杨会云。
6. 培训地点
培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼10楼,脑海科技第3会议室。
7. 报名方式
请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。
8. 联系方式
电话咨询:188 6874 4976
微信咨询:188 6874 4976
报名回执表
单位名称(发票抬头) | |
纳税人识别号(税号) | |
发票类型(会议费/培训费) | |
姓名 | |
性别 | |
电话号码 | |
微信 | |
科室/专业 | |
研究方向 | |
银行信息 |
户名:杭州脑海科技有限公司 账号:3301040160015883146 开户行:杭州银行萧山支行 |
汇款备注 | 第06期训练营 |
9. 在线支持服务
脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。