培训课程
第07期:DTI数据分析-基础训练营
2021.12.29-2022.01.02(周三 ~周日)
主办单位:杭州脑海科技有限公司
协办单位:杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心
杭州拾睿科技有限公司
1. 课程说明
磁共振成像近年来凭借其非侵入性、无辐射的优势被广泛应用于脑科学的研究中。基于结构磁共振成像可以分析大脑的灰质及白质结构,诸如灰质体积、白质体积等,亦可创建的人脑宏观可见的结构模型,进而构建大脑皮层的表层来量化人脑的功能、连接以及结构属性,并能得到皮层厚度、皮层面积等解剖参数,对研究人脑结构与发育、疾病及可塑性等问题具有非常重要的作用。
弥散张量成像(DTI),是一种无侵入性的脑结构成像技术,该技术可以通过检测水分子在大脑不同区域内的扩散特性,从而无创的评估大脑的白质纤维束走向信息。近年来,越来越多的研究中使用DTI技术,国内的许多研究表明弥散张量成像对阿尔茨海默病、慢性中风、抑郁症、癫痫以及精神分裂症等疾病的病理特异性研究起到了非常重要的作用。对于纤维束的研究,可能为脑疾病的早期诊断提供有效的技术手段。
为了帮助大家更快速地掌握大脑结构相关的数据分析方法,我们拟举办一期以结构像数据分析为专题的培训班,内容涵盖:结构磁共振成像、弥散磁共振成像、DTI数据分析、白质纤维追踪以及Freesurfer的相关使用。本课程为期5天,为确保大家在5天内可以充分的掌握内容,我们承诺:每期都会根据学员人数安排充足的助教,保证手把手指导分析数据(注:脑海科技团队一共拥有10余人的助教)。本次培训班兼具原理与操作并辅以晚课实操及复习,相信5天的学习定会对学员有所助益。
注:请提前一天到会场2021年12月28日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。
2. 课程安排
第1天 12月29日 周三 |
张韬 |
[上午] sMRI理论 |
9:00-12:00 |
结构磁共振成像基础知识 | |||
volume-based analysis & surface-based analysis | |||
CAT12与Freesurfer介绍 | |||
跨模态分析介绍 | |||
[下午] dMRI理论 |
14:00-17:00 | ||
弥散磁共振成像基础知识 | |||
弥散张量成像的分析方法 | |||
FSL介绍 | |||
总结与答疑 | |||
李杰 |
[晚上] 复习 |
18:00-21:00 | |
复习白天内容 | |||
第2天 12月30日 周四 |
黄国峰 |
[上午] DTI数据分析入门 |
9:00-12:00 |
DTI基础原理 | |||
DTI数据分析操作基本流程及FSL初步使用 | |||
FA、MD、AD、RD指标计算 | |||
TBSS数据分析原理介绍 | |||
[下午] DTI数据分析进阶 |
14:00-17:00 | ||
TBSS数据分析步骤解读及实操 | |||
DTI数据分析结果呈现 | |||
DTI数据分析结果的统计分析 | |||
李杰 |
[晚上] 复习 |
18:00-21:00 | |
复习白天内容 | |||
第3天 12月31日 周五 |
黄国峰 |
[上午] 确定性纤维追踪原理 |
9:00-12:00 |
确定性纤维追踪原理详解 | |||
确定性纤维追踪预处理及参数详解 | |||
[下午] 确定性纤维追踪实操 |
14:00-17:00 | ||
全脑纤维束构建 | |||
结果展示 | |||
王晴 |
[晚上] 复习 |
18:00-21:00 | |
复习白天内容 | |||
第4天 1月 1日 周六 |
贾熙泽 李仔麒 |
[上午] 静息态相关技术与确定性追踪 |
9:00-12:00 |
静息态功能磁共振相关技术及文章撰写注意事项 | |||
PANDA实现DTI数据预处理与FA计算 | |||
PANDA实现确定性纤维追踪介绍与实操 | |||
李仔麒 |
[下午] 概率纤维追踪 |
14:00-17:00 | |
基于确定性追踪的DTI跨模态分析 | |||
概率纤维追踪简介 | |||
概率纤维追踪实操 | |||
李仔麒 王晴 |
[晚上] 统计分析与复习 |
18:00-21:00 | |
概率纤维追踪统计分析 | |||
复习白天内容 | |||
第5天 1月 2日 周日 |
李仔麒 |
[上午] freesurfer基础 |
9:00-12:00 |
freesufer基本介绍 | |||
linux shell命令简介 | |||
recon-all命令介绍 | |||
[下午] 皮层指标计算和统计分析 |
14:00-17:00 | ||
皮层质量检查与freeview查看图像 | |||
皮层指标计算 | |||
皮层指标的统计分析 |
备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统。
3. 基础训练营授课团队介绍
基础训练营相关课程由杭州脑海科技有限公司自主研发设计,紧跟当下研究热点和研究趋势,致力于为学习者提供最全面最先进的技术,努力打造适合不同阶段学习者的课程,尽可能满足不同水平学员的需求。
脑海科技是一家专注于医学脑影像课程设计、算法研发及数据分析的科技公司。首席执行官贾熙泽兼任杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心副研究员,并担任中国心理学会积极心理学专委会委员和浙江省数理医学学会放射学专委会委员。具有计算机、心理学及神经科学交叉背景,擅长静息态磁共振方法学、基于脑影像的Meta分析,并师从任俊教授从事脑影像技术在积极心理学中的应用。目前主持国家自然科学青年基金项目1项,并作为主要合作者参与8项国自然科学基金项目。在臧玉峰教授的指导下,基于REST开发了RESTplus工具包,相关论文于2019年发表于Science Bulletin(影响因子 9.5分,40次引用)。
脑海科技有限公司于2021年组建了脑海科技有限公司认知神经科学实验室,主要从事最新脑影像算法的复现、研发及在脑疾病中的应用。基础训练营授课教师均来自脑海科技有限公司认知神经科学实验室,目前团队成员30余人,具有高度交叉背景,涵盖:计算机、统计学、心理学、临床医学以及英语等专业,每位成员受过系统化的科研培训,具有扎实的科研背景并专攻1-2个研究方向。2021年1月至今,实验室成员以主要作者在Science Bulletin、Human brain mapping、Journal of Affective Disorders等期刊发表SCI文章12篇(含接收),实验室核心成员具有比较扎实的科研基础,担任多个杂志的编辑或审稿人,包括:Science Bulletin、Neuroimage、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、Neuroimage: Clinical、Neuroimage: Report、Journal of Magnetic Resonance Imaging、Frontiers in Aging Neuroscience、Brain research、Neural Plasticity、Frontiers in Neuroscience、 Scientific Report等。
4. 培训说明
培训班限额招生15人,报满截止。我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。
5. 培训费用
费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人2900元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:19941364880,杨会云。
6. 培训地点
培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼10楼,脑海科技第3会议室。
7. 报名方式
请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。
8. 联系方式
电话咨询:188 6874 4976
微信咨询:188 6874 4976
报名回执表
单位名称(发票抬头) | |
纳税人识别号(税号) | |
发票类型(会议费/培训费) | |
姓名 | |
性别 | |
电话号码 | |
微信 | |
科室/专业 | |
研究方向 | |
银行信息 |
户名:杭州脑海科技有限公司 账号:3301040160015883146 开户行:杭州银行萧山支行 |
汇款备注 | 第07期训练营 |
9. 在线支持服务
脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。